環境保健研究所は産・官・学・研の協力体系を通じて専門的な環境教育(環境技術専門人材の養成及び研修)と環境技術支援(地域産業体及び環境行政機関に対する環境技術指導、産業体の要素技術開発、金浦地域の環境調査及び広報、環境情報交流及び共同研究)を実施することで、環境専門技術人の養成と地域一番の懸案である環境問題を産業開発とともにバランスよく発展させ地域社会発展に貢献することを主な目的とします。